MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridiales genomosp. BVAB3 str. UPII9-5 chromosome

Total Repeats: 4166

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013895	T	7	7	2	8	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013895	AGT	2	6	40	45	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013895	TAA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013895	ATT	2	6	1521	1526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013895	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013895	TATAA	2	10	1562	1571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013895	ATA	2	6	1607	1612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013895	AGA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013895	TAAC	2	8	1623	1630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013895	AG	3	6	1637	1642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013895	GCC	2	6	2811	2816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_013895	TAAA	2	8	6411	6418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013895	ACT	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013895	A	6	6	6435	6440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013895	CTTAT	2	10	6470	6479	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013895	GTTT	2	8	6485	6492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013895	AAT	2	6	7477	7482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013895	TTA	2	6	7534	7539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013895	AAT	2	6	8391	8396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013895	TAAAAG	2	12	8485	8496	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013895	TTG	2	6	8658	8663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013895	AAAGCA	2	12	8666	8677	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013895	CTT	2	6	8822	8827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013895	TTG	2	6	8835	8840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013895	GAAG	2	8	8901	8908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013895	A	6	6	8909	8914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013895	AAT	2	6	8983	8988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013895	ACAAA	2	10	9016	9025	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013895	A	6	6	9083	9088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013895	T	7	7	9120	9126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013895	TA	3	6	9146	9151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013895	ATAA	2	8	9237	9244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013895	TTG	2	6	9253	9258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013895	TAGG	2	8	9272	9279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013895	TGG	2	6	9301	9306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013895	GCG	2	6	9470	9475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013895	TGAA	2	8	10222	10229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013895	A	6	6	10231	10236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013895	TAA	2	6	10241	10246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013895	TCA	2	6	10625	10630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013895	TTA	2	6	10656	10661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013895	ATT	2	6	10667	10672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013895	TAAA	2	8	10681	10688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013895	TA	3	6	10697	10702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013895	TGA	2	6	10728	10733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013895	T	6	6	10930	10935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013895	TTG	2	6	10958	10963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013895	CTT	2	6	10997	11002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013895	GAG	2	6	11021	11026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013895	ATA	2	6	11039	11044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013895	TAT	2	6	11585	11590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013895	AAT	2	6	11643	11648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013895	GAA	2	6	11717	11722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013895	ATA	2	6	15171	15176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013895	AAC	2	6	15212	15217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013895	TGC	2	6	15224	15229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013895	ATA	2	6	15236	15241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013895	ATA	2	6	15252	15257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013895	ATA	2	6	15280	15285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013895	TAA	2	6	15300	15305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013895	GAG	2	6	17373	17378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013895	TAACT	2	10	17383	17392	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013895	AT	3	6	18705	18710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013895	CAA	2	6	18760	18765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013895	TG	3	6	18781	18786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013895	AAC	2	6	21106	21111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013895	CTGTG	2	10	21156	21165	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013895	T	7	7	21239	21245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013895	GCA	2	6	21246	21251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013895	AAT	2	6	21357	21362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013895	T	7	7	24814	24820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013895	G	6	6	24821	24826	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013895	T	6	6	24828	24833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013895	A	6	6	29438	29443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013895	GGT	2	6	29448	29453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013895	TAC	2	6	29512	29517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013895	CCA	2	6	29518	29523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_013895	CAG	2	6	31622	31627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013895	TAA	2	6	31704	31709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013895	ATT	2	6	32839	32844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013895	CCT	2	6	32845	32850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_013895	CAG	2	6	33150	33155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013895	TAA	2	6	33243	33248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013895	ATT	2	6	34372	34377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013895	CCT	2	6	34378	34383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013895	C	7	7	34399	34405	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_013895	AT	3	6	34418	34423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013895	TCT	2	6	34426	34431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013895	AAT	2	6	34456	34461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013895	TTC	2	6	34481	34486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013895	GGC	2	6	34495	34500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013895	GTTT	2	8	35816	35823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013895	T	6	6	36974	36979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013895	TTG	2	6	36988	36993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013895	AGCG	2	8	38519	38526	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013895	TG	3	6	39838	39843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013895	ATT	2	6	39847	39852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013895	AAAGT	2	10	39885	39894	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013895	TA	3	6	39901	39906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013895	AC	3	6	39907	39912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013895	AAT	2	6	40165	40170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013895	CGGTT	2	10	40464	40473	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013895	CAA	2	6	40719	40724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013895	GTA	2	6	40939	40944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013895	GGCA	2	8	40996	41003	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013895	AATC	2	8	41040	41047	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013895	T	7	7	41068	41074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013895	GCG	2	6	41078	41083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013895	ATC	2	6	41173	41178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013895	TAAGGT	2	12	43328	43339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013895	T	6	6	43580	43585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013895	ATG	2	6	43625	43630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013895	TAG	2	6	43639	43644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013895	T	6	6	45055	45060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013895	ATA	2	6	45086	45091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013895	ATT	2	6	45111	45116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013895	GAT	2	6	45129	45134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013895	CAA	2	6	45441	45446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013895	TAA	2	6	45491	45496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013895	AT	3	6	45960	45965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013895	GGA	2	6	45974	45979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013895	GTT	2	6	52168	52173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013895	GTG	2	6	52201	52206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013895	A	6	6	54268	54273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013895	T	6	6	54337	54342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013895	TCT	2	6	54392	54397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013895	TTGT	2	8	54430	54437	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013895	GTG	2	6	55719	55724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013895	GTG	2	6	55788	55793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013895	CTA	2	6	55868	55873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013895	CCCTA	2	10	55900	55909	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_013895	T	7	7	55912	55918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013895	TACC	2	8	57030	57037	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013895	ATTAT	2	10	57290	57299	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013895	CTT	2	6	57301	57306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013895	TAA	2	6	57358	57363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013895	TTTC	2	8	57364	57371	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013895	AAT	2	6	57388	57393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013895	AATA	2	8	57404	57411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013895	ATT	2	6	57452	57457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013895	GCC	2	6	57581	57586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_013895	CCT	2	6	63322	63327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_013895	GTT	2	6	63330	63335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013895	GTT	2	6	66470	66475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013895	TGT	2	6	66481	66486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013895	GTC	2	6	66506	66511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013895	CAC	2	6	66683	66688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_013895	ATTT	2	8	66707	66714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013895	ATT	2	6	66729	66734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013895	TTC	2	6	66745	66750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_013895	GCG	2	6	68120	68125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_013895	TATAG	2	10	69414	69423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013895	TGA	2	6	69471	69476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013895	GCAAA	2	10	69529	69538	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_013895	TTA	2	6	72259	72264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_013895	AAAAT	2	10	73633	73642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013895	T	6	6	73858	73863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_013895	AT	3	6	76110	76115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_013895	ATG	2	6	79306	79311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_013895	CAG	2	6	81889	81894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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280	NC_013895	TGT	2	6	123216	123221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_013895	TAGG	2	8	123356	123363	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
284	NC_013895	GCTATT	2	12	123409	123420	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
285	NC_013895	TAG	2	6	123452	123457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_013895	GGA	2	6	125044	125049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_013895	TGA	2	6	182981	182986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_013895	AGA	2	6	183444	183449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_013895	TGC	2	6	184575	184580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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